Ensinnäkin, vaikka molemmat vedenpuhdistuslaitteet voivat puhdistaa veden epäpuhtauksia, niiden puhdistusperiaatteet eivät ole samat. RO-käänteisosmoosivedenpuhdistin on varustettu RO-käänteisosmoosikalvolla sisällä. Paineen vaikutuksesta vesi voi kulkea RO-kalvon läpi, kun taas käänteisosmoosikalvo estää epäpuhtaudet, kuten epäorgaaniset suolat, raskasmetalli-ionit, bakteerit ja virukset.

Ultrasuodatusvedenpuhdistimet puhdistavat veden lähteen sisäisen ultrasuodatuskalvonsa kautta. Paine-eron paineessa vesilähde voi kulkea tämän kalvokerroksen läpi ja suodattaa epäpuhtaudet.

Kahden tyyppisillä vedenpuhdistimilla, jotka käyttävät erilaisia ​​puhdistusmenetelmiä, on tiettyjä eroja puhdistustarkkuudessa niiden periaatteiden mukaisesti. RO-käänteisosmoosivedenpuhdistimessa on RO-kalvo sisällä, ja tämän kalvon huokoset ovat nanometritason pieniä. Pienetkin virukset ja bakteerit ovat tuhansia kertoja suurempia kuin RO-kalvon huokoset. Siksi RO-kalvon läpi kulkeva vesi sisältää periaatteessa vain vettä eikä muita alkuaineita, ja suodatettu vesi voidaan juoda suoraan tai keittää.

Ultrasuodatusvedenpuhdistimessa on ultrasuodatuskalvo sisällä, ja tämän suodatuskalvon huokoskoon tarkkuusalue on 0,01–0,001 μm, mikä on yhden suuruusluokan suurempi kuin RO-käänteisosmoosivedenpuhdistimen. Samaan aikaan ultrasuodatuskalvo ei ainoastaan ​​päästä vettä läpi, vaan myös joidenkin pienten molekyylien, joiden tilavuus on pienempi, läpi, kuten joidenkin mineraalien.